Chiaramente se togli la catena separi i pignoni dal motore, ovvio.
Ma togliere la catena non serve a fugare quel dubbio, ma a capire cosa causa il rumore che come detto proviene certamente dal motore.
Pensandoci, farei anche una prova a bici spenta, perché in discesa, anche se non pedaliamo, muoviamo continuamente i pedali, questo potrebbe portare input del motore, con qualche ingranaggio che attacca e stacca.
Ha senso?
PS: se avessi una bici con Bosch le farei direttamente io queste prove, ci vogliono pochi minuti e la ripetizione di poche decine di metri di trail.